Mohutná jednolodní barokní stavba. Vstupní průčelí je rozčleněno pilastry, portálem, oknem a ukončeno volutovým štítem. Presbytář je zaklenutý elipsovitou kupolí, kostelní loď pak kupolí na pendentivech. Hlavní oltář je raně barokní (1688). Oltářní obraz sv. Havla pochází ze sázavského kláštera a byl sem přivezen v roce 1756. Boční oltáře sv. Kříže a Panny Marie jsou rovněž vyzdobeny obrazy z pozdějšího období. Jednou z nejstarších památek je cínová křtitelnice z roku 1615. Nacházela se zde také velmi vzácná socha sv. Jana Nepomuckého v životní velikosti z roku 1721, přisuzovaná dílně Matyáše Bernarda Brauna. Do Štolmíře byla darována z katedrály sv. Klimenta v pražském Klementinu. Nyní je tato socha, vyřezaná z lipového dřeva, uložena ve sbírce Národní galerie v klášteře sv. Jiří. Autorem historicky velmi cenných varhan je známý varhanář Hans Heinrich Mundt. Byly postaveny v roce 1688 pro klášter na Sázavě a do Štolmíře byly přestěhovány společně s oltářním obrazem v roce 1756.
